MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 4195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017376	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017376	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017376	TGG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017376	TGG	2	6	4307	4312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017376	GTG	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017376	ACC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017376	GGT	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017376	T	8	8	4607	4614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017376	AAT	2	6	4628	4633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017376	GAAAC	2	10	4657	4666	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017376	AC	3	6	4676	4681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017376	TAAA	2	8	4699	4706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017376	A	6	6	4792	4797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017376	ATT	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017376	T	7	7	4839	4845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017376	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017376	A	6	6	4866	4871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017376	TGT	2	6	4906	4911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017376	TTTTA	2	10	4930	4939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017376	TC	3	6	4975	4980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017376	T	7	7	5013	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017376	A	6	6	5056	5061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017376	TCA	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017376	AGT	2	6	5125	5130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017376	AAAAAG	2	12	5141	5152	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017376	C	9	9	5159	5167	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_017376	A	6	6	5168	5173	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017376	A	8	8	5182	5189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017376	A	6	6	5195	5200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017376	A	6	6	7274	7279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017376	GA	9	18	7313	7330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017376	T	7	7	7340	7346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017376	AAATT	2	10	7362	7371	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017376	T	14	14	7429	7442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017376	T	6	6	7474	7479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017376	TTTG	2	8	7485	7492	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017376	GGT	2	6	7493	7498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017376	TTG	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017376	AGCG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017376	CAAAG	2	10	7640	7649	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017376	ATAA	2	8	9698	9705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017376	TTA	2	6	9728	9733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017376	TAA	2	6	9788	9793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017376	ATT	2	6	9807	9812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017376	TA	3	6	9822	9827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017376	TTA	2	6	9833	9838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017376	T	6	6	9884	9889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017376	ATTC	2	8	9901	9908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017376	GAA	2	6	9935	9940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017376	A	6	6	12726	12731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017376	T	7	7	12753	12759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017376	AGG	2	6	12760	12765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017376	GCTTT	2	10	13618	13627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017376	T	6	6	13625	13630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017376	T	7	7	13687	13693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017376	ATA	2	6	13697	13702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017376	TTAA	2	8	13716	13723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017376	AAG	2	6	16658	16663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017376	GTTTT	2	10	16667	16676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017376	ATT	2	6	16688	16693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017376	CA	3	6	16723	16728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017376	CTG	2	6	16744	16749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017376	A	6	6	16879	16884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017376	GTT	2	6	18345	18350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017376	AAACAC	2	12	18357	18368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017376	ATCA	2	8	22766	22773	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017376	TTTCTT	2	12	23001	23012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017376	GTA	2	6	23021	23026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017376	A	6	6	23059	23064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017376	AAAAG	2	10	23070	23079	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017376	AAG	2	6	23087	23092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017376	C	7	7	23102	23108	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NC_017376	GATT	2	8	25237	25244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017376	TAAG	2	8	25275	25282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017376	ATTA	2	8	25333	25340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017376	A	18	18	25358	25375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017376	A	7	7	25425	25431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017376	A	6	6	25461	25466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017376	ATT	2	6	25481	25486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017376	TTG	2	6	25493	25498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017376	AG	3	6	25546	25551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017376	TTA	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017376	A	6	6	25633	25638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017376	TTGC	2	8	25642	25649	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017376	CGCT	2	8	25661	25668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017376	A	6	6	27056	27061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017376	T	6	6	27091	27096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017376	A	7	7	27134	27140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017376	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017376	T	6	6	28495	28500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017376	A	6	6	28527	28532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017376	ACC	2	6	29823	29828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017376	TATCAA	2	12	29860	29871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017376	GAGT	2	8	29894	29901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017376	TGCT	2	8	29948	29955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017376	CAAT	2	8	30067	30074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017376	T	6	6	30086	30091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017376	TGT	2	6	30130	30135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017376	GTT	2	6	30178	30183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017376	TTG	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017376	TCA	2	6	30222	30227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017376	TAA	2	6	30280	30285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017376	GA	3	6	30376	30381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017376	T	7	7	30445	30451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017376	TAT	3	9	30489	30497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017376	CGC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017376	ATA	2	6	30549	30554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017376	TAAA	2	8	30568	30575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017376	CTA	2	6	30581	30586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017376	A	6	6	30605	30610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017376	TGT	2	6	30719	30724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017376	TC	3	6	30760	30765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017376	TC	3	6	30791	30796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017376	CT	3	6	30883	30888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017376	AAG	2	6	30909	30914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017376	TAA	2	6	31032	31037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017376	AAG	2	6	31302	31307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017376	TGT	2	6	31316	31321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017376	TCA	2	6	31325	31330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017376	T	6	6	31372	31377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017376	GGTT	2	8	31459	31466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017376	AGC	2	6	31892	31897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017376	TAA	2	6	40103	40108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017376	A	6	6	40113	40118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017376	AG	3	6	40123	40128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017376	TAA	2	6	43677	43682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017376	CAAA	2	8	43732	43739	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017376	GT	3	6	43807	43812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017376	T	6	6	43864	43869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017376	CTT	2	6	43887	43892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017376	AG	4	8	43921	43928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017376	ATCT	2	8	43945	43952	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017376	CTGT	2	8	44006	44013	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017376	T	7	7	44076	44082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017376	CCA	2	6	44090	44095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017376	TGT	2	6	44118	44123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017376	TAG	2	6	44148	44153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017376	A	6	6	44174	44179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017376	TTGA	2	8	49771	49778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017376	TTTA	2	8	54909	54916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017376	TAA	2	6	54970	54975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017376	ATA	2	6	55001	55006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017376	ATT	2	6	55017	55022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017376	ATT	2	6	55048	55053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017376	T	6	6	55081	55086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017376	TTAAA	2	10	55180	55189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017376	ACAAA	2	10	55209	55218	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017376	G	8	8	55461	55468	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017376	ATA	2	6	55469	55474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017376	T	6	6	55489	55494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017376	AGG	2	6	55537	55542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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